近日,我院教师张莹在国际生物信息学权威期刊《Briefings in Bioinformatics》(一区Top期刊,IF=11.622)在线发表了题为“Hierarchical mixed-model expedites genome-wide longitudinal association analysis”的研究论文(DOI: 10.1093/bib/bbab096)。
张莹为该论文第一作者、黑龙江八一农垦大学为第一单位,中国水产科学研究院首席科学家、我校王震讲座教授杨润清和国家蛋鸡产业技术体系首席科学家、中国农业大学讲席教授杨宁为该文章的通讯作者。
该研究针对动态性状测定时间点多、各测定点表型记录存在遗传相关、数据不均衡、计算复杂度高等特点,提出“全基因组分层随机回归模型关联分析算法”。模拟试验和实际家禽数据蛋重生长曲线SNP位点定位分析,验证了该算法在保证动态性状全基因组关联分析统计效力的同时,极大地缩短了计算时间和计算机内存占有量,为全基因组关联分析技术在畜禽育种实践中的推广和应用奠定基础。本研究还开发了相应的分析软件Hi-RRM(https://github.com/RunKingProgram/HiRRM),供同行免费下载使用。
孙东波院长表示,近年来,学院引导教师瞄准关键问题、加强合作、潜心科研,逐步培育标志性成果。张莹老师自2017年开展家禽的数量遗传学领域的研究,经过不断尝试和努力,得到高质量成果,实属不易。我院将继续强化方向引领,打造良好科研环境,希望今后有更多教师能够针对关键问题开展研究,产出更多的优秀学术成果。